據臺灣媒體報道，安平港2010年的貨運量為123萬噸，與5年前相比下滑了近九成，目前港口營運每年虧損約1億元新臺幣。為改變這一狀況，臺南市政府與安平工業區廠商協進會等單位規劃開通安平港與廈門港之間的直航線路，已與合作航商達成初步共識，安平工業區廠商協進會也計劃赴大陸就相關事宜進行洽商。

　　安平港過去一直定位為高雄港的輔助港，以進口水泥和砂石為主。為了與鄰近的臺中港、高雄港有所區隔，安平港規劃定位為“兩岸快遞商港”，結合“云(云林)嘉(嘉義)南(臺南)”地區的直航需求，以期重振生機。

　　安平工業區廠商協進會理事長劉信利表示，臺南各工業區貨源群聚，農漁產品尤其是虱目魚列入ECFA(兩岸經濟合作框架協議)早收清單，若能就近由安平港銷往大陸，將可節省大量運輸成本。加上“云嘉南”地區的腹地支持，安平港有潛力成為“兩岸快遞商港”。此外，臺南擁有豐富的歷史文化資源，安平港開通客貨快輪固定航班，對當地旅游業發展也大有助益。