為了臺北市長任內特別費案的相關筆錄登載不實，馬英九控告承辦檢察官侯寬仁偽造文書，申請再議駁回后，并未松手，于3月間申請交付審判，對這樁極其特殊的狀告案，各界反應不一，多數人認為，以馬英九的高度，何須浪費司法資源若此，馬英九則堅定地抗拒各種爭議聲浪，強調此舉不是為了他個人，而是為千千萬萬臺灣人民的權益。臺灣《中國時報》今日發表社論指出，司法的正義和原則問題，確實不容等閑輕忽。盡管依過去的經驗，此案的獲準率低到只有千分之七，但馬英九顯然已經從他自己的個案開始，踏出了臺灣地區司法改革的第一步。
文章摘錄如下，
馬英九曾任臺當局法務部門主管，侯寬仁曾經是他相當看重的檢察官。馬英九身在其位的時候，看到的是部屬力爭是非，辛勤不輟；但當馬英九自己面臨特別費案起訴的時候，他卻看到了多數臺灣民眾身受委曲無處伸張的一面。從臺檢方起訴馬英九的公文書，對比臺北地方法院的筆錄勘驗紀錄，確實出現極大落差，證人吳麗洳說“我不知道”，到了侯寬仁筆錄竟一變而為“是的，沒錯”，難怪馬九委任律師宋耀明直指，侯寬仁為了起訴馬英九，就將筆錄登載不實。然而，侯寬仁筆錄登載不實并非特例。
法官判人生死，除了極少數不肖法官，多數法官心中總還有個警覺；檢察官是司法訴訟第一關，是否起訴、起訴的快慢與輕重，都與檢察官一念之間有關。過去最被臺灣民眾所詬病的是：凡與政治人物相關者，僅僅是起訴就能拖上3、5年，案到法院，層層審理，不拖上10年很難結案，10年人事足可全非，公平正義就在時間的拖磨中，蕩然無存。
但是，還有更多案例，是檢察官輕忽案件中當事人的權益，反正接下來是法官審理的問題，即使最后是否受到法律制裁都還有疑問，濫權濫訴卻幾成常態。甚至有當事人只經檢察官問過一次話，就遭到起訴者；還有當事人附上事假申請單，卻三傳未到就遭通緝者；種種莫名其妙的事例，既未見檢察官反省，更未見法務主管部門檢討，檢察官獨立辦案，竟成了許多民眾有冤無處申的原因之一。
[責任編輯：王賽賽]
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