根據(jù)海峽兩岸關(guān)系協(xié)會與臺灣海峽交流基金會簽署的安排如下：

　　一、時段：周末包機時段為每周五至下周一計四個全天。自七月四日起正式開始實施。

　　二、航點：大陸方面同意先行開放北京、上海（浦東）、廣州、廈門、南京五個航點，并陸續(xù)開放成都、重慶、杭州、大連、桂林、深圳，以及其他有市場需求的航點。臺灣方面同意開放桃園、高雄小港、臺中清泉崗、臺北松山、澎湖馬公、花蓮、金門、臺東等八個航點。

　　三、班次：雙方同意在周末包機初期階段，每周各飛十八個往返班次，共三十六個往返班次。根據(jù)市場需求等因素適時增加班次。

　　每周臺灣方面至上海（浦東）的班次不超過九個往返班次；大陸方面至臺中清泉崗的班次不超過六個往返班次。

　　四、搭載對象：雙方同意凡持有效旅行證件往返兩岸的旅客均可搭乘客運包機。

　　五、飛行航路：雙方同意盡快協(xié)商開通兩岸直達(dá)航路和建立雙方空管方面的直接交接程序。在直達(dá)航路開通前，包機航路得暫時繞經(jīng)香港飛行（航）情報區(qū)。

　　首次周末包機于7月4日啟動，4日當(dāng)天，共有18班包機往返兩岸，大陸航空公司分別由北京、上海（浦東）、廣州、廈門和南京5個首批開放航點往返臺北桃園和松山兩個機場，臺灣公司則由臺北、臺中、高雄、花蓮、澎湖5城市飛往北京、上海、廣州、廈門。

　　兩岸公司首月包機計劃均已排定，共計144個往返班次，從兩岸機場來看，抵離北京27班、上海70班、廣州31班、廈門12班，新開的南京航點也將有4班飛行；臺北桃園機場56班、臺北松山機場77班、高雄、臺中、澎湖、花蓮機場各有不超過5班的包機抵離。

　　首月包機的航線班期集中在周五和周日，分別有67班和40班往返，周日和周一則分別有19班和18班包機飛行。