6月16日，臺軍陸軍軍官學校舉行84周年校慶，臺灣地區領導人馬英九首次以“統帥”身份視察“三軍”，并領唱被民進黨禁了8年的原黃埔軍校校歌。臺灣陸軍軍官學校的前身是孫中山先生一手創辦的黃埔軍校，在1949年隨國民黨潰退到臺灣。此后，陸軍軍官學校一直是島內為國民黨培養軍事干部的基地。在陳水扁掌權臺灣的8年中，陸軍學校遭到降級，該校出身的將領和原黃埔系人馬均遭受打壓，取而代之的是扁系將領的雞犬升天。如今馬英九現身校慶，臺灣媒體認為這是給予軍校的高規格禮遇，“黃埔精神”將重新得到認同。
　　黃埔老將聞歌淚下

　　校慶前夜，馬英九便來到位于高雄鳳山的陸軍學校黃埔賓館住下，成為第一位在此過夜的“三軍統帥”。16日清晨5點30分馬英九就起床了，但原本和軍校學生一起晨跑的計劃，因大雨而改為在游泳池“晨泳”。為了降低所謂的“威權象征”，馬英九沒有像過去的陳水扁一樣安排閱兵，而是把慶祝典禮移到室內舉行。

　　可能是由于從政以來很少和軍隊打交道，馬英九在校慶典禮上動作顯得比較生澀。在帶領部隊高喊口號時，馬的舉手動作明顯慢了一拍，就連典禮到了那一段該站那里，馬英九都有點搞不清楚。當典禮即將進行完畢，校慶司儀說“禮成”的時候，馬英九急急忙忙要走。可是按照程序，馬英九應先轉身向孫中山遺像鞠躬，再轉回來等現場指揮官帶領部隊向他行禮之后才能離開。幸虧指揮官很機警，喊了一句“請受禮”，馬英九趕緊又走了回來，向孫中山像鞠躬，并接受臺下人的致敬。

　　慶典過程中，“黃埔”二字始終是活動的核心。包括臺前“行政院長”郝柏村、前“陸軍總司令”黃幸強上將等黃埔校友皆共同參與。此外，陸軍官校27期校友也以畢業50周年校友身份返校。當馬英九帶領全場高唱黃埔校歌時，不少黃埔老將隨著音樂潸然淚下。

　　另外值得注意的是，由于兩岸關系改善，馬英九在慶典當中向臺軍官兵講話時，沒有提大陸解放軍的“威脅”，而是用“嚇阻任何侵略的‘國防’的力量”的提法，取代臺軍過去的假想敵——解放軍。同時，馬英九還表示臺當局要展現成為“和平締造者”的決心。

　　陳水扁打壓黃埔系

　　臺陸、海、空三軍官校是臺軍培養軍官最重要的搖籃，臺軍中的絕大多數軍官出自這三所學校。其中，陸軍軍官學校因繼承了前黃埔軍校的體制，因此在“兩蔣”時期該校畢業生一如當年“黃埔系將領”，受到臺灣當局的青睞，成為一股重要的政治力量。

　　但陳水扁上臺后，為了在軍中培植自己的勢力，一步步在軍隊中去除國民黨的影響，在軍隊人事方面采取打壓陸軍軍官學校及其畢業生的手段。陳水扁首先調降了“三軍”軍官學校的級別。把臺三軍官校校長的軍銜從中將降為少將。而臺軍原政戰系統，由于是國民黨在軍隊中的政工系統級別也被降低，“政戰主任”的軍銜從少將降為上校。

　　而另一方面，曾擔任陳水扁辦公室的侍衛長的申伯之，由于與陳水扁的關系相當密切，被一路破格升任“海軍副司令”。2005年12月13日，陳水扁不顧軍中其他將領的反對，強行任命只有少將軍銜的申伯之擔任“海軍官校校長”。之后，申伯之晉升海軍中將，繼而升任“海軍副司令”。陳水扁在軍隊里大搞任人唯親、拉一派打一派的做法，讓臺軍的許多將領十分不滿。

　　縱觀陳水扁任內的幾位國防部長，只有湯曜明畢業于陸軍官校第28期，其他幾人如伍世文、李杰均出身海軍，李天羽出身空軍，到了最后一任蔡明憲就更離譜了，畢業于臺灣大學法律系。